Vēroju peptīdu darbā

2D spektroskopija ļauj "filmēt" olbaltumvielu kustības

Ļoti straujās peptīda strukturālās izmaiņas varēja "filmēt" ar 2D spektroskopijas palīdzību. © Ruhr-Universität Bochum (RUB)
lasīt skaļi

Olbaltumvielām izdodas mainīt to struktūru un līdz ar to arī funkcijas sekundes daļās. Ar jaunas tehnikas palīdzību Cīrihes un Bohuma pētniekiem pirmo reizi ir izdevies nofilmēt šīs ļoti straujās peptīdu kustības - īsus olbaltumvielu gabalus.

Šī metode ļauj mums arī noteikt, vai peptīdā divas molekulārās grupas atrodas blakus vai nē, un tāpēc ir piemērota teorētisko modeļu eksperimentālai apstiprināšanai. Pētnieki ziņo par saviem atklājumiem zinātniskā žurnāla Nature pašreizējā numurā.

Molekulāro mašīnu pārnesumi

Olbaltumvielas ir dzīves sastāvdaļa. Lielākoties tiem ir precīzi noteikta trīsdimensiju struktūra, kas ir tikai statiska: olbaltumvielas ir ļoti dinamiski objekti, kas darbojas kā “molekulārā mašīna”. Viņi pastāvīgi maina savu struktūru, saistās ar citām vielām un transportē tos līdz galamērķim, vai arī tie palielina noteiktu ķīmisko reakciju efektivitāti.

Ja olbaltumvielu vizualizēšanai būtu nepieciešams mikroskops, varētu secināt, ka atsevišķi atomi vai molekulu grupas proteīnā - molekulārā aparāta "zobrati" - aizņem neiedomājami īsu dažu pikosekundžu (0, 000 000 000 000) laika skalu. Sekundēs).

"Gaisma, kas sekundes laikā var nobraukt attālumu no zemes līdz mēness, šajā īsajā laikā rada tikai 0, 3 mm platu pikosekundi, kas aptuveni atbilst triju papīra lapu biezumam, " skaidro profesors Volframs Sanders no Ruhr-Universität Bochum (RUB), kurš kopā ar savu kolēģi profesoru Pēteri Hammu no Cīrihes universitātes ir atbildīgs par jaunajiem pētījumu rezultātiem. Tiek uzskatīts, ka daudz zina par šo straujo teorētisko aprēķinu dinamiku, taču to eksperimentālā novērošana un pārbaude izrādās ārkārtīgi sarežģīta. displejs

"Filma", izmantojot 2D spektroskopiju

Pētnieki tagad ir spējuši padarīt super-ātru maza peptīda maiņu redzamu. Viņi burtiski "filmēja" peptīdu, pārejot no vienas struktūras uz otru.

Tika izmantota jauna spektroskopiskā metode, tā saucamā divdimensiju infrasarkanā spektroskopija. Tas ļauj noteikt, vai peptīdā divas molekulārās grupas atrodas telpiski blakus noteiktā laikā. "Šis paņēmiens paver jaunu, iepriekš nepieejamu iespēju logu biomolekulu strukturālās dinamikas novērošanai un tāpēc ļauj ļoti tieši eksperimentāli pārbaudīt teorētiskos modeļus, " skaidro Sanders.

(idw - Rūras Universitātes Bohuma (RUB), 23.11.2006. - DLO)